皇帝听闻齐王遭追杀一事，龙颜大怒，命赵无极彻查此事，然后将齐王安置在他的敕宅潜龙邸中。齐王十分担心养女苏溢清的安危，请赵无极帮忙找寻。皇后与刘吉听说皇帝已知晓齐王赴京途中的险情，慌乱不已，如若事情进一步泄露，彼时两人都将人头不保。于是他们决定抹去痕迹，杀人灭口以求自保。
坠崖的申力行和苏溢清侥幸得生，漂在运河中为通州临河村村民所救，申力行被父亲的故交大夫留在自己的医馆疗伤。醒来的苏溢清立刻就要赶往京城。
追查而至的方毅带人闯入医馆，杀了一个医馆弟子仍搜寻无果，大为光火，于是纵火焚毁了医馆，申力行与医馆大夫躲藏在地窖不敢出声，在浓烟烈火中昏厥。苏益清行至起火的医馆前被方毅发现，逃入林间终遭包围，眼见着插翅难飞。正当情况急转而下，千钧一发之时，东厂高手赶来救下了她。
在潜龙邸安顿下的齐王谢绝了众大臣的拜会，阁老刘吉却执意要见齐王。齐王无奈接见了刘吉，刘吉信誓旦旦地称已经找到了一路来追杀齐王的杀手，请齐王一道前往验查。
幸免于难的申力行醒来看见父亲申梓木(黄文豪 饰)。申梓木知晓了因为申力行，医馆被毁，医馆弟子遇害，顿觉感觉无比愧疚，愤怒之下扇了儿子好几耳光，在一旁的人劝阻和申力行的赶忙认错之下，看着儿子受了箭伤才暂且住手。闻说申力行搅进齐王一事，又惊又怒。之后申力行想要去找父亲的弟子言亦冬(应昊茗 饰)，让其助自己加入六扇门，这受到了身为六扇门统带的父亲申梓木的坚决反对，申梓木想让他好好做个地主，只要平平安安守成家业就行。
抵达大牢，狡诈的刘吉与手下的锦衣卫都指挥使刘进(周帅 饰)先给齐王上演了一出苦肉计，然后拉来几具面目全非满身伤痕的尸体，将事情归罪于一些江湖草莽身上。齐王明眼，早已识破原委，但未戳穿他他们。刘吉看齐王的态度捉摸不透，且知晓其睚眦必报的风格，这更加坚定了他杀人灭口抹去痕迹的决心。
言亦冬赶来找到师傅申梓木，想请其帮助侦破一起发生在京城的凶杀案。申力行与看望自己的严亦冬谈论理想抱负，叹息空有一身本事却无门施展，表示现在的生活非自己想要。申力行青梅竹马的未婚妻龚芮溪(龚芮溪 饰 )此时进来，以为申力行不想要自己，恼羞不已，又是撒娇又是嗔怪。申力行对于自己的这个未婚妻颇为吃不消。
刘吉以锦衣卫百户之位相许，指使方毅昔日手下孙乾杀掉方毅灭口。利欲熏心的孙乾完全念及往恩旧情，带着手下围杀了方毅，取下方毅身上的锦衣卫百户铭牌，取代了他的位置。
申梓木、言亦冬与仵作一起验尸。根据死者黑黄的牙齿，申梓木判断此人生前是个大烟鬼，经常吸食大烟。至于其而下体受过阉割的迹象和面部密密麻麻的刀伤，那只是欲盖弥彰，为了达到干扰六扇门查验真相的目的，死者肋部的刀伤才是是身上的致命伤。于是，申梓木让严亦冬发动关系，去查查宫里头最近有没有失踪的公公。
苏溢清终于抵达京城，找到了齐王，并向齐王引荐化名为程咬金的申力行，说是申力行救了她，希望齐王把申力行作为立足京城的心腹。齐王也表示一定会找到申力行以报恩请，不过自己并不想久留京城，他想要回到济南封地，安心个藩王。
赵无极上门拜会。闻说齐王的萌生退意，赵无极告诉齐王，只要其离开京城，那便绝无幸理。
